水冷螺桿式冷水機組一般使用時間為3000h/年左右（根據我國氣候地理條件)。為了確保機組長期安全可靠地正常運轉，以及長期使用的運轉壽命能夠延長，減少運行費用，對機組經常性的科學維護和保養工作，是非常重要。
1.日常開、停機
日常的機組開、關機有手動和自動兩種模式，機組自動開關機設定參見各廠商“控制器操作說明書”中自動開關機部分。控制器上的開/關鍵用于手動開、關機，電控箱門上的急停開關用在機組維修、調試或緊急情況下的關機，平時一般不使用。
2.主要部件維護
(1)在運行過程中應密切注意系統的排氣、吸氣壓力，如發現異常及時找出原因，排除故障。
(2)不要任意調節控制和保護元件設定點。
(3)定期檢查電氣接線有無松動現象，如有松動要及時緊固。
(4)定期檢查電氣元器件的可靠性，應及時更換失效或不可靠的器件。
3.除垢
長期運行后，機組殼管式換熱器水側傳熱表面會沉積氧化鈣或其他礦物質，這些礦物質在傳熱表面結垢較多時，會影響傳熱性能而導致電能消耗增加、排氣壓力升高。可采用甲酸、檸檬酸、醋酸等有機酸清洗。
4.冬季關機
當冬季關機時，應清洗機組內外表面，并吹干；必須打開放水閥，放凈殼管換熱器內的存水，以防發生凍結事故。
5.春季開機
在較長時間停機后，要啟動機組時，應做如下準備工作：
(1)徹底檢查和清理機組。
(2)清潔水管路系統。
(3)檢查水泵。
(4)擰緊所有線路接頭。
(5)按要求對機組壓縮機進行預熱。
6.零件更換
更換零件應優先選用品牌廠商所供配件，不得隨便用類似配件代替。
7.制冷劑完全泄漏
如果遇到這種情況，必須用高壓氮氣（15~20公斤氣壓）或制冷劑對系統進行檢漏，如需要進行補焊，必須將系統內氣體排盡后才能進行焊接。充注制冷劑前，整個制冷系統必須是干燥的并抽真空。
8.補充制冷劑
1)在壓縮機吸氣管上的注氟嘴連接制冷劑充注瓶。
2)使冷凍/冷卻水循環，并啟動機組。
3)向系統緩慢充入制冷劑，并檢查吸、排氣壓力。
4)注意：在進行檢漏和氣密性試驗時，千萬不能向制冷系統充注氧氣，乙炔等可
9.系統防凍：
如果殼管式換熱器的流道發生嚴重結冰情況，可能造成殼管式換熱器破裂和泄漏，而凍裂損壞不屬于保修范圍，因此對機組防凍要特別予以重視。在較低環境溫度下停機備用時，若機組放在室外溫度低于0℃的環境中必須將蒸發器和冷凝器中的水排盡。放水的具體操作步驟見整機上的放水標識。
運行時，如果冷凍水水流開關失效時將可能導致水管出現凍結，因此水流開關必須與機組進行聯鎖。維護時，在給機組充注制冷劑或為了維修而放掉制冷劑時，有可能導致蒸發器內水結冰。一定要使蒸發器中的水保持流動或將水徹底放干凈。
